Organização: Regina C. Almeida (LNCC/MCTI) e Paulo F. A. Mancera (UNESP/Botucatu)

Data: 06 a 08 de fevereiro de 2017

Objetivo: reunir pesquisadores das diversas áreas do conhecimento que atuam em modelagem multidisciplinar do crescimento tumoral utilizando a matemática como ferramenta básica.

Estrutura: 1 minicurso (Biologia do Câncer); palestras convidadas e comunicações de alunos.

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MC1 - Aspectos Biológicos de Tumores - Professor: Izabel Cristina Rodrigues da Silva, UnB

Palestras (50+10min):

P1 - Bruna Cândido Guido, UnB: “Cultivo celular: Princípios básicos e suas aplicações”

P2 - Michel Iskin, LNCC: “Modelos de crescimento celular tumoral sob efeito de tratamentos quimioterápicos”

P3 - Leonardo Bermeo, COPPE/UFRJ: “Estimativa de Parâmetros e Variáveis de Estado do Tratamento para o Câncer por Hipertermia com Indução de Ondas Eletromagnéticas”

P4 - Raquel Lopes, INCA: “Redes de co-expressão gênica de oncoviroses”

P5 - Bruna Cândido Guido, UnB: “Mecanismos da migração e invasão de células tumorais”

P6 - Gustavo Benitez: “Alguns comentários sobre dois modelos de crescimentos de gliomas”

Comunicações (de 10+5min até 25+5min):

C1 - Anna Resende, LNCC: “Modelagem Hierárquica para o Crescimento Tumoral”

C2 - Vanessa Ulisses Amorim da Silva, UNESP : “Modelagem matemática dos efeitos radiobiológicos em células cancerosas”

C3 - Robinson Tavoni, UNESP: “Percepções de um modelo fracionário para a resiliência ecológica do câncer”

C4 - Heber Rocha, LNCC: “Modelagem em Três Escalas do Crescimento Tumoral Avascular”

C5 - Paulo Mancera, UNESP: “Modelos matemáticos de dormência do câncer e simulações numéricas”

C6 - Jairo Gomes da Silva, UNESP: “Modelagem Matemática sobre Dinâmica Tumoral a partir do Cálculo Fracionário”

C7 - Wesley Felipe Ferreira Mora Gil, UNESP: “Imunoterapia e um Modelo de Dinâmica de células tumorais, endoteliais e imune”

C8 - Juan Fabian, LNCC: “Calibração em um Modelo de Crescimento Tumoral”

C9 - Luciana Carvalho, INCA: “Oncoimunologia: abordagens por bioinformática”

Organização: Regina C. Almeida (LNCC/MCTI), Paulo F. A. Mancera (UNESP/Botucatu) e Francisco Lopes (UFRJ/Duque de Caxias)

Data: 28 de fevereiro a 02 de março de 2018

Objetivo: reunir pesquisadores das diversas áreas do conhecimento que atuam em modelagem multidisciplinar do crescimento tumoral utilizando a matemática como ferramenta básica.

Estrutura: 2 minicursos (Oncoimunologia e Modelos Matemáticos e Computacionais em Câncer); palestras convidadas, comunicações de alunos e apresentação de pôsteres.

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MCCT01 - Oncoimunologia - Professor: Luciana Carvalho, INCA - Aula 1, Aula 2

MCCT02 - Modelos Matemáticos e Computacionais em Câncer - Professores: Regina Almeida (LNCC), Heber Rocha (LNCC) - Aula 1, Aula 2

Palestras (50+10min):

P1 - Eliana Abdelhay, INCA: “Entendendo a biologia dos tumores através de estudos ômicos”

P2 - Herbert Guedes, UFRJ/Duque de Caxias: “Aspectos básicos da imunidade anti-tumor”

P3 - Wellington Betencurte da Silva, UFES/Alegre: “Seleção de modelos e estimação de parâmetros e estados para modelos de crescimento de tumores via filtro Bayesianos”

P4 - Bruna Loiola, COPPE/UFRJ, CEFET/Angra dos Reis: “Identificação da decomposição térmica de tecidos biológicos em tratamentos por ablação a laser”

P5 - Marcelo Alves Soares (INCA): “O microbioma e o câncer”

P6 - Alexandre Ramos, USP: “Stochastic model of contact inhibition and the proliferation of melanoma in situ”

Comunicações (de 10+5min até 25+5min):

C1 - Paulo Mancera, UNESP: “Modelo matemático de dinâmica de células tumorais e imunes: análise de estabilidade e simulações numéricas”

C2 - Francisco Lopes, UFRJ: “Uma estratégia de Biologia de Sistemas aplicada ao estudo da regulação gênica e sinalização celular”

C3 - Ondina Palmeira, UFRJ: “Mecanismo de proteção das células tronco germinativas de Drosophila melanogaster contra irradiação e cisplatina”

C4 - Diego Rodrigues, UNESP: “Modelagem matemática dos efeitos biológicos da radiação ionizante”

C5 - Paulo Wander Barbosa, UFES/Vitória: “Implementação e Estudo de um modelo contínuo-discreto de crescimento tumoral usando Análise Isogeométrica”

C6 - Raquel Lopes (INCA): “Co-expression network interactions using multi-omic data in head-and-neck squamous cell cancer HPV+ and HPV- profiles”

C7 - José Mir Justino da Costa (UFAM): “Seleção de Modelos de Crescimento Tumoral usando Approximate Bayesian Computation”

C8 - Claudio Daniel Tenório de Barros, LNCC: “Ferramenta de Calibração de Modelos de Reação-Difusão aplicada a Oncologia”

Pôsteres:

1 - Gabriel Kleiman, Universidade Federal do Rio de Janeiro - Campus Duque de Caxias: “Um modelo de sinalização para quiescência em células tronco germinativas de Drosophila melanogaster”

2 - Jairo G. Silva, Instituto Federal de Mato Grosso, IFMT, Barra do Garcas, MT: “Modelagem Matemática de Crescimento Tumoral da Tireóide”

3 - Mauro Cafundó de Morais, USP: “Stochastic model for the loss of contact inhibition and image analysis of melanoma cell proliferation”

4 - Alexandre Sarmento Queiroga, USP: “A stochastic model for heterogeneity of carcinoma in situ”

5 - Willian Wagner Lautenschlager, USP: “Theoretical analysis of the formation of melanoma clusters among keratinocytes and melanocytes”

6 - Alan Utsuni Sabino, USP: “Modelo estocástico para perda de inibição por contato na formação do melanoma in situ”

7 - Heber L. Rocha, LNCC: “An Integrated Continuum-Discrete Tumor Growth Model”

8 - Brendon J. Rodrigues, LNCC: “A continuam description of vascular tumor growth”

9 - Regina C. Almeida, LNCC: “Selection, calibration, and validation of models of tumor growth”

10 - Brendon J. Rodrigues, LNCC: “Modelagem matemática da interação entre o sistema imune e o câncer”

11 - Vanessa U. A. Silva, Diego S. Rodrigues, UNESP: “Ajuste de parâmetros de um modelo matemático para curvas de crescimento de populações de células tumorais”

12 - Raquel Lopes (INCA): “Co-expression network interactions using multi-omic data in head-and-neck squamous cell cancer HPV+ and HPV- profiles”

Organização: Regina C. Almeida (LNCC/MCTI) e Paulo F. A. Mancera (UNESP/Botucatu)

Data: 20 a 22 de fevereiro de 2019

Objetivo: reunir pesquisadores das diversas áreas do conhecimento que atuam em modelagem multidisciplinar do crescimento tumoral utilizando a matemática como ferramenta básica.

Estrutura: 1 minicurso (Radiobiologia); palestras convidadas, comunicações de alunos e apresentação de pôsteres.

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MC01-CT - Radiobiologia - Professor: Helena Regina Comodo Segreto, UNIFESP

Palestras (50+10min):

P1 - Luciana Carvalho, INCA/USP: “Oncoimunologia: abordagens por bioinformática”

P2 - Raquel Lopes, INCA: “Dos dados 'ômicos' à modelagem de sistemas biológicos: aplicações e desafios”

P3 - Helcio Orlande, UFRJ: “An Inverse Problem Related to a Hyperthermia Experiment in-vitro”

P4 - José Mir Justino da Costa, UFAM: “Seleção simultânea e calibração de modelos para a proliferação de células normais e tumorais”

P5 - Artur Fassoni, Universidade Federal de Itajubá: “Modelagem matemática do tratamento de Leucemia Mieloide Crônica revela possibilidade de redução substancial de dose de Inibidores de Tirosina-quinase”

P6 - Rafael Bonfim, UFJF: “Analisando a evolução de tumores de mama através de campos de fluxo ótico”

P7 - Gustavo Benitez, UFF/Volta Redonda: “Dois modelos matemáticos para o crescimento de gliomas”

P8 - Gabriela Nestal de Moraes, INCA: “Mecanismos induzidos pelos quimioterápicos nas células tumorais”

P9 - Gabriela Nestal de Moraes, INCA: “Mecanismos de resistência aos quimioterápicos”

P10 - Francisco Jose Pereira Lopes, UFRJ/Duque de Caxias

Comunicações (de 10+5min até 25+5min):

C1 - Paulo Mancera, UNESP

C2 - Diego Rodrigues, UNIFAL: “A mathematical model for chemoimmunotherapy of chronic lymphocytic leukemia”

C3 - Anna Resende, LNCC: “Model selection for assessing the effects of doxorubicin on triple negative breast cancer cell lines”

Pôsteres

Organização: Regina C. Almeida (LNCC/MCTI), Paulo F. A. Mancera (UNESP/Botucatu), Luciana R. Carvalho Barros (ICESP)

Data: 04 a 06 de março de 2020

Objetivo: reunir pesquisadores das diversas áreas do conhecimento que atuam em modelagem multidisciplinar/interdisciplinar do crescimento tumoral utilizando a matemática e a computação como ferramentas básicas.

Estrutura: 2 minicursos (Modelagem Matemática do Câncer e Evolução Tumoral in Silico); palestras convidadas, comunicações de alunos e apresentação de pôsteres.

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MC01-CT - Modelagem Matemática do Câncer - Professores: Paulo Mancera (UNESP/Botucatu) e Diego Rodrigues (Unicamp)

MC02-CT - Evolução Tumoral in Silico - Professor: Guido Lenz (UFRGS)

Palestras (50+10min):

P1 - Martin H. Bonamino (INCA): Abordagens de terapias com células T expressando Receptores Quiméricos de Antígeno (CARs)

P2 - Luciana R. C. Barros (ICESP/USP): Oncoimunologia e imunoterapia: lições e modelos

P3 - Mauro Cafundó de Morais (ICESP/USP): Modelo Estocástico de Proliferação Celular e verificação por Análise de Imagens

P4 - Alexandre Ramos (USP): Limited inhibition of multiple nodes in a driver network blocks metastasis

P5 - Rafael Bonfim (UFJF): Análise do crescimento tumoral usando métodos de fluxo ótico

P6 - Nilton P. da Silva (COPPE/UFRJ): Hipertermia e quimioterapia: simulações computacionais e estimativa de parâmetros em experimentos in vitro

P7 - Felipe Kitamura (UNESP/DASA): IA no auxílio ao diagnóstico e tratamento do câncer

P8 - Guido Lenz (UFRGS): Modelagem da dinâmica populacional na tumorigênise

Comunicações (25+5min):

C1 - Jairo G. Silva (UNESP-Botucatu): A mathematical model with Allee effect applied to the treatment of papillary thyroid cancer

C2 - João Vitor O. Silva (LNCC): Bayesian inference using Gaussian Process Surrogates in cancer modeling

C3 - Emanuelle Arantes Paixão (LNCC): Model comparison and uncertainty quantification in tumor growth

C4 - Daniela Polessa Paula (ENCE): Modelos longitudinais para avaliação do impacto da mudança de protocolo em reações adversas a quimioterapia

Pôsteres:

1 - Jessica Correia S. Alves, Valeria Mattos da Rosa (UFJF): “Análise de Controle Ótimo de um Modelo Matemático de Crescimento Tumoral com Quimioterapia e Dieta Cetogênica”

2 - Jairo G. Silva (Unesp/Botucatu), Rafael M. Morais (IMEB), Izabel C. R. Silva (UnB), Paulo F. A. Mancera (Unesp/Botucatu): “A mathematical model applied to the treatment of papillary thyroid cancer”

3 - Janielly Matos Vieira, Edgard Lourenço Júnior, Diego Samuel Rodrigues, Paulo Fernando de Arruda Mancera (Unesp/Botucatu): “Modelo matemático de crescimento tumoral envolvendo o sistema imune e metástase”

4 - Luiz Augusto Scheuermann França, Louise Reips (UFSC): “Modelagem Matemática de Sistemas Tumorais: Uma Análise do Crescimento de Tumores sujeitos à Quimioterapia Antiangiogênica”

5 - Laura Costa Pereira Miranda (UFS): “Controle Ótimo em Terapias de Câncer - Angioterapia”

Organizers: Regina C. Almeida (LNCC/MCTI), Paulo F. A. Mancera (UNESP/Botucatu), Luciana R. Carvalho Barros (ICESP)

Virtual Meeting: Jan. 27th - 29th, 2021

We aim at gathering researchers from different areas of knowledge who work in multidisciplinary/interdisciplinary modeling of tumor growth using mathematics and computing as basic tools.

Schedule:

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MC01-CT - Desenvolvimento e calibração de modelos tumorais - Professores: Ernesto Lima (UT at Austin) e Emanuelle Arantes Paixão (LNCC)

MC02-CT - Imunologia do Câncer - Professora: Adriana Bonomo (IOC/Fiocruz)

Keynote Lectures (50+10min):

K1 - Gabor Balazsi (Stony Brook University): Oncogenic Fitness Landscapes Inferred from Gene Expression Control

K2 - Mark Chaplain (University of St. Andrews): A Mathematical Framework for Modelling the Metastatic Spread of Cancer

K3 - J. Tinsley Oden (UT at Austin): Phase Field Models of the Growth of Tumors Embedded in an Evolving Vascular Network: Dynamic 1D-3D Models of Angiogenesis

Talks (30-40 + 5min):

T1 - Luciana Barros (ICESP): Imunoterapia com células CAR-T em pacientes: da medicina a modelagem

T2 - Eugênia Terra-Granado Pina (Fiocruz, BA): Associações entre imunofenótipos, achados genético-moleculares e o microambiente tumoral em Leucemias Agudas, necessidade de integração dos dados

T3 - Alexandre Ramos (USP): Heterogeneity: can we reconcile signal and noise?

T4 - Artur Fassoni (Universidade Federal de Itajubá): Aplicações clínicas da modelagem do tratamento de Leucemia com uso de dados do sistema imunológico

T5 - João F. Meyer (UNICAMP): Os desafios da Modelagem Matemática de situações-problema reais encaminhados por um Centro de Pesquisa: uma atividade na graduação

T6 - Heber Rocha (University of Indiana at Bloomington) and Inês Godet (PhD Candidate, Johns Hopkins University): A persistent invasive phenotype in post-hypoxic tumor cells is revealed by novel fate-mapping and computational modeling

T7 - Helcio Orlande (COPPE/UFRJ): Optimization under Uncertainty of the Hyperthermia Treatment of Cancer

T8 - Jairo Gomes da Silva (IFMT/Barra do Garças): Modelos matemáticos de tratamentos ao carcinoma diferenciado da tireoide refratário a iodo radioativo

T9 - Helena Araujo (UFRJ): Aspectos quantitativos na modelagem do desenvolvimento embrionário com foco na atividade de NFkappaBs

Poster Sections (Oral presentations, 15 + 5min):

P1 - Janielly Matos Vieira (UNESP, Programa de Pos-graduação em Biometria, Botucatu), Diego S. Rodrigues (UNICAMP, FT, Limeira), Paulo F. A. Mancera (UNESP, IBB, Botucatu): Modelo matemático de dinâmica tumoral envolvendo o sistema imune

P2 - Maria E. Antunes (Postgraduate Program in Biometrics, Unesp, Botucatu), Izabel C. R. Silva (University of Brasília), Paulo F. A. Mancera (UNESP, IBB, Botucatu), Jairo G. Silva (IFMT/Barra do Garças): Study of RAI treatment on metastatic thyroid cancer by computational simulations of a mathematical model

Organizers: Regina C. Almeida (LNCC/MCTI), Paulo F. A. Mancera (UNESP/Botucatu), Luciana R. Carvalho Barros (ICESP)

Virtual Meeting: Feb. 14th - 16th, 2022

We aim at gathering researchers from different areas of knowledge who work in multidisciplinary/interdisciplinary modeling of tumor growth using mathematics and computing as basic tools.

Schedule:

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MC01-CT - Uma introdução a análise de sistemas dinâmicos - Professor: Artur C. Fassoni (Universidade Federal de Itajubá)

MC02-CT - PhysiCell: an opensource framework for multicell modeling - Professores: Heber L. Rocha e Aneequa Sundus (University of Indiana at Bloomington)

Palestras (50+10min):

P1 - Anthony McGoron (Florida International University): Challenges and opportunities for improving cancer therapy through multi-scale and multi-physics computational modeling

P2 - Guillermo Lorenzo Gomez (Oden Institute for Computational Engineering and Sciences, The University of Texas at Austin): Imaging-informed, organ-scale computational modeling of prostate cancer growth

P3 - Rodrigo Nalio Ramos (ICESP/USP): Caracterização de subpopulações de macrófagos em tumores por single-cell RNA sequencing

P4 - Helder Nakaya (USP): A Bioinformática na Medicina de Precisão

P5 - Roger Chammas (USP): Apoptosis-induced tumor cell proliferation: an under-appreciated obstacle for cancer therapy

Comunicações (C:30+10min e SC:20+5min):

C1 - Ernesto Lima (Oden Institute for Computational Engineering and Sciences, The University of Texas at Austin): Combination therapy optimization in HER2+ breast cancer

C2 - Andrea G. Campos Bianchi (Departamento de Computação, UFOP): CRIC Searchable image database: Plataforma para extração de conhecimento em imagens

C3 - Matheus Mendonça (Microsoft Research): Aprendizado de máquina na medicina

C4 - Gustavo Benitez (UFF/Volta Redonda): Alguns comentários sobre modelos radiobiológicos aplicados a gliomas

C5 - Alexandre Ferreira Ramos (USP): Application of physics methods for diagnostics and treatment of cancer

C6 - Luciana Carvalho (ICESP/USP): Imunoterapia com células CAR-T em pacientes: da medicina a modelagem

C7 - Kelly Iarosz (Faculdade de Telêmaco Borba, Universidade Tecnológica Federal do Paraná): Modelagem e decisões clínicas: um paralelo presente e necessário

SC1 - Maria Eliza Antunes (PPG Biometria, Unesp, Botucatu): Modelagem matemática de tumores de mama sob efeito de quimioterapia

SC2 - Edgard Lourenço Júnior (PPG Biometria, Unesp, Botucatu): Um modelo matemático para o câncer de pulmão de células não pequenas

SC3 - Gustavo Naozuka (PPG Modelagem Computacional, LNCC): Identificação de sistemas dinâmicos: uma aplicação na modelagem do câncer

SC4 - Daniela Santurio (PCI/LNCC): CAR-T Cell Therapy for brain tumors: a mathematical model and sensitivity

SC5 - Helcio R. B. Orlande (COPPE/UFRJ): Heat Transfer Analysis of Spheroids Partially Loaded with Nanoparticles and Irradiated by a Laser

Organizers: Regina C. Almeida (LNCC/MCTI), Luciana R. Carvalho Barros (ICESP), Paulo F. A. Mancera (UNESP/Botucatu)

Virtual Meeting: Jan. 25th - 27th, 2023

We aim at gathering researchers from different areas of knowledge who work in multidisciplinary/interdisciplinary modeling of tumor growth using mathematics and computing as basic tools.

Schedule:

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MC01-CT - Inteligência Artificial no estudo de imagens - Professor: Alexandre Ramos (Universidade de São Paulo)

MC02-CT - Novos tratamentos para Oncologia - Professores: Luciana Barros, Luciana Andrade, Silvina Bustos, Renata Saito, Andrea Otake, Tharcisio (Instituto do Cancer do Estado de São Paulo)

Palestras (50+10min):

P1 - Guido Lenz (Departamento de Biofísica, Universidade Federal do Rio Grande do Sul): Geração de heterogeneidade fenotípica do câncer

P2 - Russel Rockne (Beckman Research Institute, City of Hope National Medical Center): Data driven model discovery and interpretation for CAR T-cell killing using sparse identification and latent variables

P3 - Rui Travasso (Centro de Fisica da Universidade de Coimbra): Adhesion modulates cell migration, erythrocyte morphology and endothelial cell dynamics

P4 - Helcio Orlande (Universidade Federal do Rio de Janeiro): Design by stochastic simulations of the thermal ablation treatment of tumors with high intensity focused ultrasound

P5 - Victor Pérez-Garcia (Mathematical Oncology Laboratory (MOLAB), University of Castilla-La Mancha, Spain): How evolutionary dynamics shapes cancer aggressiveness: A mathematical approach

Comunicações (30+10min):

C1 - Cristina Rangel (ICESP/USP): Células tronco tumorais em câncer de mama triplo-negativo

C2 - Carlos A. Condat (IFEG, CONICET, 5000-Córdoba, FaMAF, Universidad Nacional de Córdoba, 5000-Córdoba, Argentina): Can Differentiation Therapy Control Cancer-Stem-Cell Driven Tumors?

C3 - Ana Paula Lepique (ICB/USP): Mecanismos de imunomodulação de câncer cervical

C4 - Emanuelle Arantes (PPG/LNCC): Modelagem da dinâmica das células CAR-T com diferenciação fenotípica

C5 - Giuseppe Romanazzi (IME, Unicamp): Primeiras Fases da Formação do Câncer Colorretal: Modelagem Matemática e Métodos Numéricos

C6 - Rafael Glaber (Universidade de Brasília - Departamento de Engenharia Mecânica, Grupo Vortex - Mecânica dos Fluidos de Escoamentos Complexos): Dinâmica de Langevin aplicada ao estudo hipertermia magnética para fins de tratamento de pequenos tumores

C7 - Marsha Rosner (Universidade de Chicago): Vias intracelulares em câncer

C8 - Chengyue Wu (UT at Austin): MRI-based digital twins for the patient-specific prediction and optimization of neoadjuvant chemotherapy response in triple-negative breast cancer

C9 - Heber Rocha (The University of Indiana at Bloomington): A multiscale model of melanoma pulmonary micrometastasis and immune surveillance: towards cancer patient digital twins

C10 - Daner Silveira (Instituto do Câncer Infantil do Rio Grande do Sul): Modelagem computacional da transição epitélio-mesenquimal em células de mama: identificação de novas moléculas necessárias para a estabilização fenotípica